Daha Sonra yeni mekânlara ihtiyaç duyulması üzerine 1962 yılında Selçuklu dönemi eseri olan Gökmedrese Camiine nakledilmiştir.
1958 yılına kadar fahri memurlukla idare edilen müze aynı yılın haziran ayından itibaren Müze Müdürlüğüne dönüştürülmüştür.
1977 yılında bugünkü binasına taşınmış ve 1980 tarihinde ziyarete açılmıştır
